Quelques soit le choix d'exercice , il faut vous inscrire à l'ordre du lieu d'exercice ou votre lieu de résidence (si vous serez remplacant) 

remplacement en libéral

permet d'exercer librement tout en limitant les contraintes de l'installation ( investir, gérer un cabinet, constituer sa patientèle) . Voir différentes manières d'exercer la médecine libérale, différente organisation . 
un contrat de remplacement doit toujours être établi et penser à rajouter une rubrique comme le délai de paiement après le remplacement et changer la clause d'installation si vous pensez vous installer à proximité. modèle de l'ordre

poste de salarié en centre de santé

poste de salarié en centre de santé communautaire

poste salarié à l'hopital

installation en libéral

seule, création ou association avec d'autres médecins, intégrer une maison de santé pluri professionnelle. 
Le médecin devient un chef d'entreprise avec plus de liberté car c'est vous le patron mais plus de responsabilités ( investissement, cotisation sociales, comptabilité , fiscalité....) 
De nombreuses formes juridiques existent. cf ce lien

Bien sure vous pouvez avoir une activité mixte:

une partie salariée et une partie libérale